Современные условия предъявляют серьезные и противоречивые требования к системе информационно-аналитического обеспечения МНС России, поэтому крайне актуальными становятся вопросы научного подхода к комплексной автоматизации процессов формирования развития налоговой системы РФ.

Для проведения фундаментальных, поисковых и прикладных научно-исследовательских работ по проблемам автоматизации в ГНИВЦ была создана Научно-исследовательская лаборатория стратегических исследований в области автоматизации налоговых органов.

Основная задача лаборатории состоит в выявлении проблем, возникающих при автоматизации налоговой системы РФ, и их исследовании в рамках научно-исследовательских и опытно-констукторских работ. Результатом деятельности НИЛ являются подготовка научно обоснованных рекомендаций по модернизации и совершенствованию существующей автоматизированной информационной системы, построение оптимальных моделей деятельности налоговых органов и выработка предложений по применению достижений информационных технологий как в краткосрочной, так и в долгосрочной перспективе.

Научно-исследовательская лаборатория ГНИВЦ МНС РФ осуществляет свою деятельность в соответствии с Планом Научно-исследовательских работ ГНИВЦ МНС РФ, который является частью Плана Министерства Российской Федерации по налогам и сборам.

За время, прошедшее после создания лаборатории в 1999 году, в лаборатории были выполнены научно—исследовательские работы по следующим направлениям:

• Разработка информационно—математической модели налоговой системы Российской Федерации. Построенная модель адекватно отражает развитие не только налоговой системы, но и всей экономики Российской Федерации. Она позволяет в сжатые сроки рассчитывать экономический эффект от принятия тех или иных законов или подзаконных актов, направленных на совершенствование налоговой системы России, и представляет собой мощный инструмент оптимизации концепции и показателей экономического развития;
• Разработка методики обновления компьютерного парка. Эта работа, выполненная с участием известных молодых математиков России, основывается на использовании современного аппарата математической теории массового обслуживания и имеет своим результатом рациональные иерархические и стохастические стратегии модернизации компьютеров, находящихся в распоряжении налоговых инспекций. Проведенные расчеты показывают, что внедрение методики в практику МНС России позволит существенно увеличить возможности по решению практических задач при сохранении бюджетных средств, выделяемых на закупки;
• Разработка Концептуальных основ создания сети центров обработки данных (ЦОД) в МНС России. Одна из основных задач, решаемых путем создания сети ЦОД, состоит в "разгрузке" персонала налоговых инспекций от выполнения рутинных работ по вводу и последующему анализу данных, поступающих от налогоплательщиков. Это высвобождает их время для выполнения главной задачи, стоящей перед налоговыми органами, контроля за соблюдением налогового законодательства;
• Разработка методов выявление ухода от уплаты налогов и отбора налогоплательщиков для проведения выездных проверок. Указанные методы основываются на использовании современного аппарата математической статистики и технологии нейросетей;
• Выработка рекомендаций по совершенствованию технологии разработки программных средств.
• Разработка методики формирования единой формы документа (свидетельства) о постановке на налоговый учет налогоплательщиков в государствах участниках Договора от 29 марта 1996 года (НИР "Единство"). На основе анализа предложений государств - участников Договора от 29 марта 1996 года разработаны предложения по введению "Единого налогового удостоверения на территориях стран Евроазиатского экономического сообщества". Обоснован рациональный состав показателей данного удостоверения и требования по их заполнению.
• Разработка методики применения единой формы документа (свидетельства) о постановке на налоговый учет налогоплательщиков в государствах участниках Договора от 29 марта 1996 года (НИР "Участник"). В работе обоснованы предложения о статусе "Единого налогового удостоверения на территориях стран Евразийского экономического сообщества" и сфере его применения. Предложен порядок и условия выдачи Единого налогового удостоверения юридическим и физическим лицам стран Евразийского экономического сообщества. Разработаны концептуальные положения по автоматизированному информационному обмену между налоговыми органами стран Евразийского экономического сообщества на основе анализа существующего информационного обмена между государствами участниками.

В 2002 году сотрудники лаборатории приступили к разработке стохастической теории оценивания налогового потенциала и теории жизненного цикла информационных систем.

Помимо научно—исследовательской работы, в 2000 году лаборатория приступила и к выполнению научных работ других видов — подготовке научных кадров и научно—методическому сопровождению учебного процесса. В настоящее время в составе лаборатории трудятся два доктора наук и несколько кандидатов наук. Ведется работа по открытию аспирантуры и учреждению специализированного диссертационного совета.